La principale stazione della Slovacchia è quella di Bratislava Hl St (Hlavnà Stanica), posta in centro città. La sua inaugurazione è avvenuta nell’agosto del 1848, ma negli anni è stata sottoposta a un grande lavoro di ristrutturazione e ammodernamento. La stazione di Bratislava Hl St è dotata di 8 binari sui quali transitano i treni Intercity, Regionali e Eurocity, diretti in Germania, in Austria, in Repubblica Ceca, in Ungheria, in Serbia, in Polonia e nel resto del territorio della Slovacchia. I treni di Bratislava sono gestiti da ZSSK e da RegioJet. Il sovraffollamento ferroviario sta generando la necessità di spostare il flusso di alcuni treni verso le vicine stazioni di Nove Mesto e Petrzalka, che non hanno ancora del tutto sfruttato il loro potenziale. Da questo scalo si possono prendere le coincidenze con i bus locali della MHD o con i tram 1 e 2 diretti in centro.
| Durata | Primo e ultimo treno | Treni al giorno | |
|---|---|---|---|
| A Budapest | 2h 23m | 4:50 – 23:50 | 18 |
| A Vienna centrale (stazione centrale) | 56m | 4:50 – 23:50 | 20 |
| A Ljubljana | 6h 47m | 4:50 – 20:50 | 13 |
| A Zurigo centrale | 9h 20m | 4:50 – 23:50 | 18 |
| A Berlino | 9h 14m | 4:50 – 22:55 | 16 |
| A Innsbruck Hbf | 5h 40m | 4:50 – 23:50 | 19 |